Die Theologische Fakultät betreibt  theologische und  religionswissenschaftliche Forschung.

Neben den von den verschiedenen Lehrstühlen verantworteten Forschungsprojekten bestehen die folgenden wissenschaftlichen Schwerpunkte:

Literatur- und Religionsgeschichte der Bibel in ihren antiken Kontexten (Bibelwissenschaft)

Theologische Ethik

Antikes Christentum

Schweizerische Reformationsgeschichte

Hermeneutik und Religionsphilosophie

Praktische Theologie

Historische und vergleichende Religionswissenschaft

Religionswissenschaft mit sozialwissenschaftlicher Ausrichtung

Religionswissenschaft mit systematisch-theoretischer Ausrichtung

Zentrum für Religion, Wirtschaft und Politik