An der Theologischen Fakultät können sowohl im Bachelor als auch im Master die Studienrichtungen Theologie und Religionswissenschaft als Major- bzw. Monostudienprogramme (Hauptfächer) studiert werden. Im Master wird das Angebot durch den Joint Degree Masterstudiengang «Religion, Wirtschaft, Politik» und die Spezialisierten Masterprogramme «Antikes Judentum», «Christentum in der Gesellschaft» und «Religion and Culture in Contemporary Societies» ergänzt. Auf beiden Studienstufen bietet die Theologische Fakultät zudem eine Reihe von Minor-Studienprogramme (Nebenfächer) an.

Neben den Bachelor- und Master-Studiengängen umfasst das Angebot auch allgemeine Doktorate sowie strukturierte Doktoratsprogramme in Theologie und Religionswissenschaft.